[VIP第1年] 指数:3
Ct（阈值循环）是扩增曲线与阈值线的交叉点（图 1B）。它是 PCR 反应中靶标浓度的相对测量。除靶标浓度之外，还有很多因素会影响 Ct 的***值。我们将要讨论最常见的可能影响 Ct 值的非模板依赖性因素，并描述如何评估实时荧光定量 PCR 反应的性能，北京DNA甲基化荧光定量PCR实验技术服务。
显示实时反应扩增图的几个参数。图 1B 中的**期对应于图 1C 中的线性期，北京DNA甲基化荧光定量PCR实验技术服务。阈值必须设在扩增图的线性期中。Ct 值随模板量减少而增加。然而，反应混合物或仪器中的任何干扰，只要能影响与 Ct 计算相关的荧光测定，都会使 Ct 值产生非模板依赖性的变化，北京DNA甲基化荧光定量PCR实验技术服务。因此，在不同条件下或用不同试剂进行的 PCR 反应产生的 Ct 值不可以直接进行比较。
比较Ct值的相对定量法：此方法是将待测靶基因片段和内参照基因片段同时扩增，可以在两个反应管中或者一个反应管中进行扩增反应，并且就两者的ct值之差进行测量。在采用此方法过程中需要用数学公式进行相对量的计算，首先要假设每个循环产物增加一倍时PCR反应**期得到Ct值对起始模板的量一个循环的估算和起始模板数两倍相当。这种方法的前提是靶基因和内源控制物的扩增效率基本一致，所以在应用过程中效率的偏移会对实际拷贝数估计产生一定影响，因此，为了保证目的基因和内参基因的扩增效率相等应当加强对反应体系的优化，这也是该方法应用的难点之一
在PCR扩增时加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针，该探针为一寡核苷酸：5’端标记一个报告荧光基团，3’端标记一个淬灭荧光基团。探针完整时，报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时，Taq酶的5'-3'外切酶活性将探针酶切降解，使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离，从而荧光监测系统可接收到荧光信号。
在荧光扩增曲线上人为设定的一个值，它可以设定在荧光信号**扩增阶段任意位置上，但一般荧光阈值的设置是PCR反应**-15个循环荧光信号标准偏差的10倍。
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