无论 Ct ***值是多少,任何能够有效扩增和检测起始模板拷贝数为 1 的系统都达到了灵敏度的极限,江苏**基因荧光定量PCR检测服务。
如前文所述,效率是决定反应灵敏度的关键因素(图 5)。在检测极低拷贝数时的另一个重要的考虑因素是,不能预期模板为正态分布。相反,它会遵循泊松分布,该分布预测在平均包含一个拷贝的起始模板的大量重复中,江苏**基因荧光定量PCR检测服务,江苏**基因荧光定量PCR检测服务,实际上约 37% 不含拷贝,*有约 37% 含有 1 个拷贝,18% 应包含 2 个拷贝(见图 9)。因此,为了可靠地检测低拷贝,必须做大量的重复实验来提供统计***性,以克服泊松分布的限制。
RNA清洗 移去上清液,每1mlTRIZOL试剂裂解的样品中加入至少1ml的75%乙醇(75%乙醇用DEPCH2O配制),清洗RNA沉淀。混匀后,4℃下7000rpm离心5分钟。
RNA干燥 小心吸去大部分乙醇溶液,使RNA沉淀在室温空气中干燥5-10分钟。
溶解RNA沉淀 溶解RNA时,先加入无RNA酶的水40μl用***反复吹打几次,使其完全溶解,获得的RNA溶液保存于-80℃待用。 1)紫外吸收法测定
先用稀释用的TE溶液将分光光度计调零。然后取少量RNA溶液用TE稀释(1:100)后,读取其在分光光度计260nm和280nm处的吸收值,测定RNA溶液 浓度和纯度。
PCR 反应的效率也会影响 Ct 值。在低效率条件下进行连续稀释扩增,与高效率条件下相比,可能会产生斜率不同的标准曲线。在图 5 中,两个样品(X 和 Y)分别在低效率和高效率条件下扩增,在靶浓度相同的条件下得到了不同的 Ct 值。在此示例中,尽管高效率条件(图 5 中的蓝色曲线)在高浓度时产生的 Ct 值更晚,但它在靶浓度低时却更为灵敏。PCR 效率取决于实验、预混液性能和样品质量。通常情况下,反应效率在 90-110% 之间都是可以接受的。另一方面,假定所有其他因素如仪器、试剂和实验完全相同, 该效率也有助于得出***个样品的模板量更少的结论。然而,如果产生两个 Ct值使用的是不同的仪器、试剂、引物和探针或反应体积,该结论就不成立。因此,只有在使用上文定义的相同反应条件来比较实验时,Ct ***值的比较才有意义。
文章来源地址: http://nongye.m.chanpin818.com/nlmyxmhz/deta_3914379.html
免责声明: 本页面所展现的信息及其他相关推荐信息,均来源于其对应的用户,本网对此不承担任何保证责任。如涉及作品内容、 版权和其他问题,请及时与本网联系,我们将核实后进行删除,本网站对此声明具有最终解释权。