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荧光染料可与双链DNA结合，每个循环的延伸阶段，染料掺入双链DNA中，上海临床疾病荧光定量PCR技术服务，上海临床疾病荧光定量PCR技术服务，其荧光信号强度与PCR产物的数量呈正相关。同时，其缺点也在于其非特异性，上海临床疾病荧光定量PCR技术服务。当PCR反应中有引物二聚体或者非特异性扩增时，该染料也可以和这些非特异性扩增产物结合，发出荧光，从而干扰对特异性产物的准确定量。

常用的染料为SYBR Green I，各公司针对荧光信号强度、***作用等进行改进，也推出了很多新的染料供大家选择。

Promega采用新型荧光染料BRYT Green® Dye，对qPCR反应没有***作用，与双链DNA结合后荧光信号更强.

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实时荧光定量 PCR，又称为定量 PCR 或 qPCR，可以为测定样品中的靶标序列或基因数量提供简单、简洁的方法。该方法高度简化，有时会忽略实现方法方面的关键因素，因此导致出现问题。本文将重点强调设置和评估实时荧光定量 PCR 反应时必须考虑的这些因素。

实时荧光定量 PCR 数据的图形表示。Rn 是报告基团染料的荧光除以惰性参比染料的荧光的比值；即，Rn 是归一化到 Applied Biosystems™ ROX™ 染料的荧光信号的报告基团信号。(A) 在此视图中，Rn 根据 PCR 循环数进行绘制。(B) ΔRn 为 Rn 减去基线；ΔRn 根据 PCR 循环数进行绘制。(C) 扩增图显示对数 (Δrn) 随 PCR 循环数的变化。

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